O principal foco na área de saúde é trabalhar na resposta ao HIV e Aids. Isso inclui ações e projetos que incluam as pessoas mais afetadas pela epidemia.
Dentre as ações permanentes em saúde está a divulgação de orientações sobre prevenção das infecções sexualmente transmissíveis- IST e HIV/Aids e agravos correlatos.
Uma das suas áreas específicas é o Núcleo de Mulheres PositHIVas com ações que incluem prevenção, apoio à adesão ao tratamento, sexualidade e combate ao estigma e discriminação.
Se trabalha na qualificação para o ativismo e as ações de base comunitária, com foco nas novas tecnologias, como as mídias digitais.
Motirô BA também participa de eventos de capacitação promovidos por outras OSC (como o GAPA Bahia) ou centros universitários (Ex. UNIJORGE).